‘善男子！譬如清净摩尼宝珠，映于五色，随方各现，诸愚痴者，见彼摩尼实有五色。

　　此复举喻。以前喻磨镜，垢尽明现，显以幻离幻。此喻摩尼，随方现色，显即幻即真。清净摩尼宝珠，龙王髻中所有。梵语摩尼，此云如意。能如人意，雨一切宝故。此珠具足体、相、用三大之义。其体，则清净宝贵；其相，则内外明澈；其用，则随方现色。由珠体清净，珠明明彻，故映于五色，其用自在，随方各现也，珠，喻净圆觉心；五色，喻五蕴身心；随方各现，喻随业所感，各现五蕴身心；愚人，喻迷位众生，不了如幻，妄执实有五蕴身心。‘华严经’云：‘凡夫见诸法，但随诸相转，不了法无性，以是不见佛。’

　　此珠可喻三性：摩尼，喻圆成实性，即前所显之理；现色，喻依他起性，即前所有诸幻；愚人定执实色，喻遍计执性，即前妄认身心。此亦印前文，若对摩尼，所现之色，不执实有，则种种色，一一同体清净，皆属圆珠妙用，无色可离，但能了依他如幻，不起遍计妄执，当体即是圆成。以喻后文，根身器界，一一清净。此亦显后文。

　　‘善男子！圆觉净性现于身心，随类各应，彼愚痴者说净圆觉实有如是身心自相，亦复如是。

　　此约法以合。圆觉净性，合摩尼珠，即圆成实性。现于身心（即五蕴幻躯），合现五色。随类各应者：即随十二类众生之业，各应以十二类，五蕴身心。此即圆觉随缘，循众生之业以发现。各类五蕴，合映于五色，随方各现，即依他起性。彼愚痴者：指我法未空之众生。说净圆觉，实有如是身心自相，合诸愚痴者，妄见实有五色，即遍计执性。故总合云：亦复如是者，亦如摩尼现色，妄执实有者是也。丑一印前显后竟。

　　丑二 拂迹入玄

　　‘由此不能还于幻化，是故我说身心幻垢、对离幻垢、说名菩萨。

　　由此乃承上彼愚痴者，说净圆觉，实有如是身心自相；由此不能远离诸幻化相，是故我说身心，皆为净圆觉心，所现幻垢。凡妄认身心为己，未离幻垢者，名为众生。对此众生，则已离幻垢者，说名菩萨，以不执身心实有，了知身心如幻故。

　　‘垢尽对除，即无对垢及说名者。

　　幻垢如珠中之色，本无可离，但了达即空，即是垢尽。所对之垢既尽，能对亦除，故曰：垢尽对除。此拂迹也。即无对垢，及说名者：此二句，诸家所解不同。今按本文解释，上文云对离幻垢，说名菩萨，此则众生之幻垢已尽，即无所对幻垢之众生，及说名离垢之菩萨。者字，即指菩萨。到此对待情亡，乃成绝待，不独所对幻垢之众生，了不可得，即能对之菩萨，亦不可名，以归平等本际，此入玄也。丑二拂迹入玄竟。

　　丑三 圆彰法界

　　寅一 一真法界

　　‘善男子！此菩萨及末世众生，证得诸幻灭影像故，尔时便得无方清净。无边虚空，觉所显发。

　　此承前启后。菩萨及末世众生，皆指求净圆觉之人。观行已成，证得如幻三昧，则一切诸幻影像，悉皆得灭。不妄执随方所现之五蕴，以为实有，破除我法二执，如不执摩尼珠，实有五色也。尔时便得无方清净者：尔时，即证得圆觉，灭除幻垢之时。便得者，即得也。无方清净，乃周遍清净，不定方所，非一方二方清净，所谓无处（方，即处也）不清净也。

　　无边虚空，觉所显发者：圆觉妙心本净，昔为无明诸幻所障，但见诸幻，妄执实有，不得周遍清净。到此幻尽觉显，不但空中，所有身心世界，了不可得，即无边虚空，皆为觉性之所显发，亦不可得。如‘楞严经’所云：‘一人发真归元，十方虚空，悉皆销殒。’十方顽空销殒而圆觉真空显发，广大圆明，无有边际，即净极光通达，寂照含虚空。本有大光明藏，寂而常照，含裹十方虚空，皆成寂灭真境。惟妙觉明，圆照法界，了无一法当情。此即众生清净觉地，亦即如来因地，圆照清净觉相是也。一一真法界竟。

　　寅二 三重法界

　　卯一 真空绝相观

　　‘觉圆明故，显心清净；心清净故，见尘清净。

　　此下，显净圆觉心，周遍清净之相。本科显真空妙理，绝相清净。下二科，广显互遍互融，摄入无碍。极显题中，大、方、广三义，体、相、用一一不可思议。首句承上云：觉心圆满明净故，则无有一法，而不清净。即一清净，一切同时清净也。所谓复本心源，究竟清净。惟一觉性圆明寂照，但以语不顿彰，文中不得不次第而显也。显心清净者：此指赖耶心（第八识），非指意识心（下文有意识故），今观行成就，无明幻灭，圆觉清净，遂显此赖耶心，同时清净。心清净故，见尘清净者：承上赖耶心，既已清净，则依自证分，所起之见分，亦同时清净。见分由无明力，转本有智光，而成能见之妄见，即六种染心之一，故以尘名，非眼根所见之色尘，为见尘也。心、见二皆清净故，一一周遍清净，唯一妙明，圆照法界，自内及外，自近及远，自凡及圣，以显究竟清净之相。非见尘清净之后，闻尘、觉尘等，相继清净。亦非眼根眼识，清净之后，诸根诸识，相继清净。文虽前后次第而说，只因语不顿彰之故。此等自应当知。如‘楞严’所云：‘但于一门深入，入一无妄（即显心清净），彼六知根，一时清净（即见尘、闻尘、觉尘、知尘、悉皆清净）。’以元是一精明，分作六和合故也。

　　‘见清净故，眼根清净；根清净故，眼识清净。

　　见分清净之故，眼根同时，与之俱净。根不能自见，因有见分，分作六和合。在眼曰见，故见净，根即与俱净也。根清净故，眼识清净。由来根识难分，故唯识云：愚者（指声闻愚法之人）难分识与根。当知根是所依，识是能依。由根对尘，识依根起。前五识缘自分境（如眼识缘色尘等），惟第六识，能遍缘六尘之境（明了意识，与前五识俱起，缘前五尘境，独头意识，缘法尘之境），根既清净，则根不缘尘。根境不偶，识无从生，故眼识与眼根，而同时清净。

　　‘识清净故，闻尘清净；闻清净故，耳根清净；根清净故，耳识清净。

　　第一识字是眼识。接上文起，此处当知，并非眼识清净之后，闻尘才清净。此闻尘与见尘，同为六精，（‘楞严经’：名见精，闻精，乃至知精。是带妄之见分，总名为见分，别名为六精。带妄即带同分别业，二种妄见，故此经名为见尘、闻尘等。名虽有别，体则无殊，故皆名尘）见精清净，六精同时清净。耳根与耳识，亦同前眼根与眼识，随见分同时清净也。

　　‘识清净故，觉尘清净；如是乃至鼻、舌、身、意，亦复如是。

　　此文，例前眼根眼识，俱与见尘，同时清净，其余觉尘知尘，乃至鼻、舌、身、意，诸根诸识、无不同时清净。此先约内身清净，下推至外境清净。

　　‘善男子！根清净故，色尘清净；色清净故，声尘清净；香、味、触、法，亦复如是。

　　六根清净故，自内及外，六尘亦复如是，同时清净，此外清净也。

　　‘善男子！六尘清净故，地大清净；地清净故，水大清净；火大、风大亦复如是。

　　此承上内外根尘既净，内外四大，亦同时俱净。不取根发识，尘牵心之义，直取根尘，四大和合之体也。

　　‘善男子！四大清净故，十二处、十八界、二十五有清净；

　　此约世间诸法。十二处，即内能缘根六处，外所缘尘六处。十八界，即根、尘、识，三六十八，各有界限。二十五有者：即欲界、色界、无色界。三界亦名三有：欲有、色有、无色有；亦名九有：以三界有九地（六欲天以下，是五趣杂居地；初禅、离生喜乐地；二禅、定生喜乐地；三禅、离喜妙乐地；四禅、舍念清净地，此色界四地。无色界、亦有四地：空无边处地、识无边处地、无所有处地、非想非非想处地），广言二十五有。古德颂云：‘四洲、四恶趣，六欲、并梵天，四禅、四空处，无想、阿那含。’通称有者，以其有因必有果，因果不亡，故谓之曰有。是三界内众生，所依住故。此二十五有清净，即三界六凡依正，悉皆清净。此世间法清净也。