《大日经》把密宗的指导思想概括为三句话：“菩提心为成佛的种子，大悲为根本，方便为究竟。”就是说，学修密宗首先要发菩提心，菩提心是成佛的种子，是“因”；其次，要有救度众生的大悲心，这种大悲心犹如树根，可以使菩提心滋生繁衍，开花结果，所以为“根本”；再次，本着以上的原则，万事均圆融、善巧，方为圆满相，所以为“究竟”。

　　密宗以“六大”为体，就是以“六大”作为理论基础，一切理论与实践都是围绕着“六大”展开的。
　　“六大”，也称“六界”，密宗里视其为构成世界的基本元素，是密宗对宇宙本原的解释。
　　地大――指一切坚性的物质；
　　水大――指流质性的物质；
　　火大――指光、热一类的物质；
　　风大――指气体；
　　空大――指前四大的性象本质；
　　识大――指心，包括受、想、行、识。

　　“六大”又有六性：坚，温，暖，动，无碍和了别；
　　五用：不坏，摄持，离散，长养，自在和识别；
　　六形：方，圆，三角，半月，宝形和杂形；
　　六色：黄，白，赤，黑，青，杂。
　　宇宙间的一切现象均不出“六大”的这五用、六性、六形、六色。当然，佛和众生也都是由“六大”所构。因此在密宗里，称“六大”为“大日如来”，它无所不在，如光明遍照。“六大”中的前五大为“色法”，属于“胎藏界”，是大日如来（六大）的显现，表现在理性方面，就是说众生本来具备的无量智慧，被隐藏在烦恼之下，不被　显现，故名“胎藏”。而“识大”为心法，属于“金刚界”，是大日如来（六大）的本体，表现在“智性”方面，就是说众生的光明觉性如金刚一般，一但开启，就会无坚不摧，可以断除一切烦恼，故名“金刚”。 宇宙万物，无论佛与众生都是色心不二，理智为一的统一体，关键在于是否开启了“金刚界”的种子。从此意义上讲，佛――智慧无限的觉者与众生没有根本差别。众生若能开启 金刚种子，断除烦恼，具足圆满智慧，即为佛。修持密法的行者，正是通过适当的方法，从“金刚界”下手，从“识”上下手，转识成智，即可即身成佛。