大师刚开始习禅时，由于尚未得参究要领，故久无消息。乃专心念佛，日夜不断，净念相续，不久即有感应。

　　一天晚上，梦见阿弥陀佛现身，立于空中，相好光明，了了分明。大师行接足礼，并祈求见观世音、大势至菩萨。愿毕即见二菩萨现半身......自从梦中现此瑞相之后，大师时时都感到三圣炳然在目前，因而对修行增加了极大的信心。

　　这一年冬天，慈恩寺禅堂启建道场，请无极大师讲《华严悬谈》，憨山大师在讲席期间受具足戒，并随众听讲。当听到十玄门，海印森罗常住处.......恍然了悟法界圆融无尽之旨意，心中生起对清凉澄观的仰慕之情。由此为自己立字为“澄印”。并请证于无极大师，大师说：“你志入此法门了。”

　　一闻此言，憨山大师似乎遥见冬积坚冰、夏飘飞雪的清凉山。从此自感行住坐卧皆入冰雪之境，无丝毫热恼。出世之念更加刻骨铭心。大师二十岁的那一年冬天，云谷大师于天界寺建禅期。憨山大师与海内大德五十三人前往参加。开初坐禅不知用心诀窍，甚感苦恼，即拈香请益。

　　云谷大师开示审实念佛公案。从此参究得法，一念不移，三个月内如在梦中。不见有大众，也不知日常行事。但由于用心太急，背部生一大疮，肿痛难忍。大师自知为宿世怨业现前，乃搭袈裟跪于韦驮菩萨像前哀切恳祷：待禅期结束后，愿诵《华严经》十部以还宿债。祈祷后顿感异常

　　疲倦，一上禅床即熟睡，开静也不知道。天亮以后，云谷大师问起背疮一事，大师答：没有事了。看背上果然了无痕迹，平复如初。见闻者无不惊叹。禅期满，大师坐禅堂，感觉仍未离禅坐，即便上街入闹市中，也不见有人，如入无人之境。