朱熹哲学的核心是“理”。“理”是其哲学的出发点和归宿，但它必须借助于“气”而“造作”，依“气”而“安顿”；“物”是“理”的体现和表象，是“理”借“气”而派生的。他说：

　　未有天地之先，毕竟也只是理。有此理，便有此天地；若无此理，便亦无天地，无人无物，都无该载了。有理，便有气流行，发育万物【《朱子语类》卷一，中华书局，1981年，1页。】。

　　在朱熹的哲学中，“理”不仅是宇宙万物的本原，而且是人类社会的最高原则。“理”不仅具有先天性，而且又是一个不变不动的清净之体，“若理，则只是净洁空阔底世界，无形迹，他却不会造作”【《朱子语类》卷一，3页。】。同时，“理”也是“极好至善的道理”【《朱子语类》卷一○○，2549页。】，在未发之前处于无形无言无位的绝对空静状态中，但是又包孕着动静两端，在动静阴阳中涵蕴着万事万物【《朱子语类》卷九四，2369页。】。但是，在这种“理”的本体地位下，理为本，气为末。由于“理”虽然是绝对的“一”，但是“气”却分阴阳之“气”，生五行之“质”，阴阳五行化生万物【《朱子语类》卷一，9页。】，于是，统一的“理”在万事万物中却有种种不同的呈现。

　　朱熹“理”与“气”的关系，与《起信论》中“心真如门”与“心生灭门”关系十分相似。尤其对于“理”的规定，更是“心真如门”相似。而且，朱熹同样引入了“理一分殊”，他说：

　　或问理一分殊，曰：圣人未尝言理一，多只言分殊。盖能于分殊中事事物物、头头项项分得其当然，然后方知理本一贯。不知分殊各有一理，而徒言理一，不知理一在何处？圣人千言万语教人，学者终身从事，只是理会这个要得事事物物、头头件件各知其所当然，而得其所当然，只此便是理一矣【《朱子语类》卷二七，677～678页。】。

　　朱熹把太极作为宇宙的本体，太极是宇宙的普遍规律、万物的存在根据。一切万物都禀受此理以为性，以为体。万物之性虽然是“分”（禀受）自太极而来，但并不是分有了太极的一部分，因为每一物的性理与作为宇宙本体的太极是相同的，所以说“万物之中各有太极”。所以，这种“理一分殊”与《起信论》的“心真如”也是十分相似，万物都具备真如理，万物的真如是平等无差别的，所以能“一多相摄”，也就是“理一分殊”了。