灵芝原产于亚洲东部，产地主要分布在中国、朝鲜半岛和日本。中国分布最广的在江西。紫芝则产于浙江、江西、湖南、四川、福建、广西、广东等地，也有人工栽培。世界上灵芝的种类主要分布在亚洲、澳洲、非洲及美洲的热带及亚热带，少数分布于温带。地处北半球温带的欧洲仅有灵芝属的4种，而北美洲大约5种。中国地跨热带至寒温带，灵芝科种类多而分布广。

　　中国灵芝自然分布的总特点是东南部多而西北部少。如果从东北部的大兴安岭向南方向的西藏东南部画一条斜线，便可将灵芝的分布划分为迥然不同的两大区，正好说明灵芝科种类的分布与中国的地形地貌、生态环境相吻合。目前已知此条线以西由于干旱或高寒等原因，缺乏灵芝繁殖生长的天然条件，只分布有树舌和灵芝两种。在青海、新疆和宁夏几乎没有发现常见的赤芝。赤芝主要分布长白山和台湾地区，并以长白山灵芝和台湾的樟芝最为著名。