石斛的副作用很小，临床上认为甘平无毒。但是石斛能敛邪, 使邪不外达，所以温热病不宜早用石斛。石斛其又能助湿，如湿温尚未化燥者忌服。此外，石斛惟胃肾有虚热者宜之, 虚而无火者忌用。

　　因此可见石斛的副作用很小，几乎可以忽略不计。同时石斛的的历史史书有多篇幅的文献记载，可以看出石斛在远古时期就已经广泛使用。