一般情况下小的结石往往活动的范围比较广，容易磨伤尿路粘膜引起出血、肾绞痛；大的结石，可长期压迫尿路粘膜，使上皮脱落、组织溃疡，以至结石与输尿管管壁形成粘连，特别严重的甚至产生癌变。

　　尿路感染：

　　结石通常都是含有很多病菌的，如果任由肾结石长期的存在男性的体内，就会引发感染，而肾积水继发感染后可形成肾积脓，严重的尿路感染还可能造成败血病，威胁人的生命。另外，尿路感染又可使结石迅速增加。

　　肾功能不全：

　　肾结石在合并尿路梗阻时，尤其是双侧尿路梗阻或在此基础上合并严重感染，病人可出现肾功能不全。当梗阻解除和感染得到有效控制，部分病人。肾功能可好转或恢复正常。

　　泌尿系梗阻：

　　肾结石结石致泌尿系管腔内堵塞可造成梗阻部位以上的积水。结石性梗阻常为不完全性梗阻，有的结石表面有小沟，尿液可沿小沟通过；有时结石虽较大，甚至呈铸状结石，但尿仍能沿结石周围流出，也可能在长时间内不引起积水，肾盂壁纤维组织增生变厚时，则扩张表现不明显。

　　肾组织为脂肪组织代替：

　　肾结石肾盂肾炎的肾组织萎缩后可为脂肪组织所代替。肾脏维持其原形但普遍缩小。肾包膜与肾的表面紧密黏连，肾组织萎缩而硬化。严重病例所剩肾组织极少，甚至完全消失。肾实质与肾盂肾盏间为灰黄色的脂肪组织所以填充。