1、初"五十三佛"——在《观药王药上二菩萨经》中："药上菩萨为行者称说过去五十三佛名，告言法子，过去有佛名曰普光，次名普净……次名一切法常满王佛。尔时药上菩萨说是过去五十三佛名已，默然而住。尔时行者即于定中得见过去七佛世尊，第一毗婆尸佛赞言：善哉善哉，善男子，汝所宣说五十三佛，乃是过去久远旧住娑婆世界成熟众生而涅槃者，若有善男子善女人，及余一切众生，得闻是五十三佛名者，是人于百千万亿阿僧祗劫不堕恶道；若复有人能称是五十三佛，生生之处常得值遇十方诸佛；若复有人能至心敬礼五十三佛，除灭四重五逆及谤方等诸罪皆悉清净，以是诸佛本誓愿故，于念念中即得除灭如上诸罪。次尸弃如来、毗舍浮如来、拘留孙如来、拘那含牟尼如来、迦叶如来亦如是赞五十三佛名已，亦复赞言：善男子善女人，能闻是五十三佛名者，能称名者、能敬礼者，除灭罪障如上所说。尔时释迦牟尼佛告大众言：我曾往昔无数劫，于妙光佛末法中出家修道，闻是五十三佛名，欢喜合掌，教他闻持，他人闻已复行转教，如是展转相教至三千人，异口同音称五十三佛，复一心敬礼，以是因缘功德，即超大型无数劫生死之罪，即成过去劫千佛、现在劫千佛、未来劫千佛是也。"释迦牟尼佛，就是现在贤劫千佛中的第四尊。经又接着说："十方现前诸佛，善德如来等，亦曾闻是五十三佛名，故于十方面各皆成佛。"《佛名经》说："三千诸佛因礼五十三佛，灭除积习，得成正觉。"故知十方所有众生，若欲灭四重禁罪，欲得忏悔五逆十恶，欲得除灭无根谤法极重之罪，当敬礼七佛，复当敬五十三佛，然后遍礼十方无量一切诸佛，心想明利行忏悔法，自然感应道应，众罪消灭。

　　2、次"三十五佛"——大宝积部《决定毗尼经》说：舍利弗，一切菩萨有二犯戒，何等为二？一者嗔相应犯；二者痴相应犯。如是二犯，名大破戒。舍利弗，因贪犯者为过微细，难可舍离。因嗔犯者过为粗重，易可舍离。因痴者为过深重，复难舍离。所以者何？贪结能为诸有种子，生死蔓延连持不绝，以是义故微细难断。因嗔犯者堕于恶趣，可速除断。因痴犯者当堕八大地狱中难可解脱。舍利弗，若诸菩萨成就五无间罪及犯余罪，菩萨应当于三十五佛前，昼夜独处殷重忏悔。"《宝积经》说："一切众生若有五逆十恶，万劫不通忏悔者，应须顶礼三十五佛至心忏悔，一切罪障即皆除灭也。"

　　3、《大忏悔文》中之所以加上阿弥陀佛为归结者，因为至心称礼阿弥陀佛一声，能灭八十亿劫生死重罪；释迦世尊与十方诸佛同赞阿弥陀佛愿力，佛正在西方说法度生故；阿弥陀佛虽在西方，而其悲心来度娑婆众生，临终十念尚得往生故阿弥陀佛法身与十方诸佛一样，是十方法界无尽功德藏身，以其四十八愿宏深，与娑婆世界众生机缘最胜，诸所作功德归一则道易成，故以称礼阿弥陀佛作结。今弥陀禅寺加阿弥陀佛成八十九佛之意亦本于此。