位于青海省扎毛乡的宗俄寺,传说其第三世小活佛曾劝化青海地方蒙藏百姓归顺清朝,得到朝廷嘉奖,赐给诏书和象牙印章。诏书写于白布之上,3000余字,盖有三印,绘有日月花纹图案。觉让寺是玉树地区古老的18座巴绒噶举派寺院之一,历史上颇有名气,明廷所赐的白法螺、十八部黑纸金字大藏经,用象牙雕刻的金刚亥母像,以及传为格萨尔使用过的“直藏楞耶响”宝刀等,一直被视为最珍贵的圣物,供奉于寺院中。明王朝还授予该寺各种权益,一直免交赋税,寺院定期为皇帝诵经祈福,成为定制,一直延续到民国时期。囊谦的乜也寺,在清代显赫一时,清廷曾赐有翎帽、印章、灰色旗帜等。

邦囊寺内保存的嘎寺活佛所赐、传为文成公主赐赠的转经筒,名为“觉直嘉囊玛”,日夜由两名扎哇转动,供奉以长明灯。而位于巴塘乡的“大日如来佛堂”,亦称“文成公主庙”。唐中宗景龙四年(公元710年),唐蕃再次联姻,金城公主入藏时见文成公主主持雕刻的佛像被风雨剥蚀,遂令随从盖一殿堂。公元730年又派人摹刻佛像,修饰加固殿堂,并在殿堂门旁刻石记载:“为了祝愿万民众生,赤德祖赞父子幸福平安,佛教昌盛,依照原刻佛像再加工精雕细刻,修盖此殿。”据考证,佛堂两边崖壁上,有吞米桑布扎亲手写的藏文嘎治、梵文、藏文美术字和文成公主手书、汉文楷书,以及众多的佛像、佛塔、经文、六字真言等。湟中县的塔尔寺,是宗喀巴大师的降生地,受到历代中央王朝的高度重视。从康熙以来,朝廷多次给以赐赠,有匾额、法器、佛像、经卷、佛塔等。寺中各扎仓的活佛,如阿嘉、赛赤、拉科等还一度成为驻京呼图克图,有的还当过北京雍和宫和山西五台山的掌印喇嘛。因为这些特殊原因,塔尔寺发展迅速,跻身藏传佛教格鲁派六大寺院之一。

甘肃藏传佛教寺院,由于明朝扶持,分封给上层僧人以国师等名号,使藏传佛教寺院在西北地区得到了大规模的发展。河州(今临夏回族自治州)的弘化寺、显庆寺;岷州的大崇寺、卧龙寺;凉州的庄浪寺、广善寺等十几座寺院都受到明朝册封。其中迭部县的电尕寺,由八思巴大师的弟子跋喜饶巴尔所建,原藏有元朝忽必烈汗所赐用金汁书写在蓝黑色纸上的《甘珠尔》大藏经、八思巴的帽子等文物;天祝达隆寺,康熙皇帝御赐寺名“护国寺”、赐给土登嘉措大喇嘛马鞍鞯一副、黑金官印、白檀香木官印各一枚,另有文书、圣旨等;夏河县的拉卜楞寺,保存着清道光帝颁发三世嘉木样的敕封印玺、光绪二十五年(1899)皇帝给第四世嘉木样的敕封及民国二十三年(1934)政府对嘉木样五世的册封,另有金、银、铜、象牙、石、木等大小印鉴21。