刘宋文帝元嘉十二年（西元435年），梵僧求那跋陀罗法师经由海路到达广州，曾於制旨寺创建戒坛，并且立碑预言：「以后将有一位肉身菩萨於这个戒坛受具足戒。」到了梁朝天监元年（西元502年），梵僧智药三藏法师从天竺国带来一棵菩提树，栽种於这个戒坛旁边，并且也预言：「往后一百七十年，将会有一位肉身菩萨於这棵树下，开演无上微妙法，传佛心印，广度无量众生。」制旨寺於唐朝贞观年间改为法性寺，至明宪宗成化二年（西元1466年）称为光孝寺。

　　智药三藏法师从天竺国度海来到中国，从南海经过曹溪口时，曾掬溪水而饮，觉得曹溪水甘美如露，与天竺国之水无二无别，知道曹溪的源头必定是宝地。果然，到了上游的源头，环顾四周，山水蜿蜒，峰峦奇秀，智药三藏法师向随行的徒众说：「这里简直与天竺国的宝林山一样啊！」智药三藏法师告诉曹侯村的居民：「大众可以在这座山上兴建宝刹，在一百七十年后，无上甚深的佛法将会在这座宝刹弘化开演，依这个心法修行成就的人，就像这茂密的树林一样多，所以，这座宝刹以宝林寺为名是最恰当的了。」预言曹溪宝林寺的法水将如泉涌不尽，润泽十方。

　　时光奔驰如箭，唐朝贞观十二年的四月八日（佛诞日）子时，岭南新州（今广东省新兴县）的卢府，毫光腾空，异香满室，随着奇妙的祥瑞卢夫人产下了一个男孩。第二天，晓光初露时，来了两位异僧，他们对孩儿的双亲说：「恭喜两位喜获贵子！这孩子长大后将是佛法的法门龙象，希望将他取名为惠能；惠者，以大法惠施众生；能者，能弘扬真理、大作佛事。」两位异僧说完话就离开卢府，转眼间就消失无踪。

　　惠能三岁丧父，家道中落，到长大时，家中已非常贫穷，平日便以卖柴为生，来奉养母亲。日月如梭，惠能已经二十四岁。这一天，因缘和合，惠能送柴到店里，听到有人正在诵经，宿慧使然，一闻经文，顿有所悟。便询问客人所诵何经，这位客人告诉惠能他诵的是《金刚经》，是得自黄梅东禅寺五祖弘忍大师，五祖常劝大众受持《金刚经》，就能体悟本具的般若智慧。这位客人劝惠能往黄梅参谒五祖，又致送十两白银给孝顺的惠能安顿母亲。一切都安排妥当，惠能就从广东出发往湖北省黄梅县参礼五祖弘忍大师；并於五祖座下彻悟心性，得五祖传衣付法，其后为了躲避其他门徒争夺衣钵，惠能在猎人队中保任用功，隐藏了十五年后才下山，来到广州的法性寺。

　　唐朝仪凤元年（西元676年），在法性寺，这一天是正月十五日，就在智药三藏法师所种植的菩提树下，印宗法师为惠能剃除须发。二月八日，邀集西京智光律师为授戒师，苏州慧静律师为羯磨师，荆州通应律师为教授师，中天耆多罗律师为说戒师，西国蜜多三藏为证戒师，就在求那跋陀罗法师所建的戒坛，共同为六祖惠能大师授具足戒。六祖大师旋即於这棵来自西天的菩提树下开示直指人心、见性成佛的顿悟法门。正如碑文所记：「后当有肉身菩萨於此受戒。」亦如智药三藏法师所预言：「往后一百七十年，将会有一位肉身菩萨於这棵树下，开演无上微妙法，传佛心印，广度无量众生。」从梁朝天监元年至唐朝仪凤元年，中间相隔正是一百七十五年。

　　第二年的春天，六祖惠能大师回到宝林寺，大开法筵，高树顿教幢幡，说法利生三十七年，从六祖这里契悟宗旨而弘化各方的有四十三人，悟道而超凡的出家众与在家众，人数无法计量。果然如智药三藏法师所说，得法宝而成就者多如丛林。

　　智药三藏法师当年所栽种的菩提树，树根是生於枝干上，有千百根自上垂下包裹着枝干，所以只见根而不见枝干，经过千余年，如今更是翠绿繁茂，树旁的碑志文辉映着阳光，闪闪发亮，彷佛告诉世人一百七十年前与一百七十年后祖祖相互呼应的示现，正是勉励世人，诸佛诸祖都由人成，只要努力修行，契悟本心，直下承担就是啊！